wqq,Miniconda 相当于app storeimage.png 1 安装Miniconda(在Ubuntu下) 查看服务器是多少位的:输入命令 uname a wget h...
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Miniconda
相当于app store
1 安装Miniconda(在Ubuntu下)
查看服务器是多少位的:输入命令
uname -a
wget
下载安装【sh是脚本(就是一个程序,后台的代码)文件的后缀,也就是说其实这是一个下载的脚本,如果你安装失败了,这个脚本是不需要重新下载的,还是可以用的。】按 “回车”(不是写)
激活
source .bashrc
conda deactivate
#conda config --set auto_activate_base false
检查安装
conda list
配置镜像文件并查看channel
conda config --get channels
conda config --remove channels
成果
2 利用miniconda安装软件
conda install 软件名称(ex.cutadapt)
软件安装conda update 软件名
软件更新- 若不确定软件名称,可以先使用搜索:
conda search fastqc
- 安装特定版本软件:
ex. conda install bwa=0.7.12
conda remove 软件名
软件卸载
安装fastqc
conda install fastqc -y
(我装不了)这个参考
1
2打开安装包
unzip 名.zip
3 卸载conda(应该一般不会卸载吧 😂)
rm -rf ~/miniconda3
vi ~/bash_profile
.condarc 、.conda、 .continuum
4 运行环境
conda info --envs
查看环境conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
新建环境!conda activate rna-seq
激活环境conda deactivate
退出环境
wqq
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